Automatic genome annotations

자동 유전체 주석 기능을 통해, 공개 또는 로컬 데이터베이스에 저장된 기존 패턴과 주석 정보를 기반으로 새로운 유전체를 자동으로 주석 처리할 수 있습니다. ORF는 이러한 패턴과 NCBI 검색 결과를 바탕으로 가상 유전자로 주석 지정됩니다.

Transfer annotations

유사성 기반 주석 또는 정렬 결과를 활용한 주석 이전이 가능합니다. Glimmer를 이용한 유전자 예측, 원하는 염기서열을 복사하여 모티프 검색, Phobos를 활용한 반복 서열 탐지가 가능합니다.

Real-time sequence prediction

Geneious Prime에서는 실시간 서열 예측 기능을 통해 여러 작업을 수행할 수 있습니다. DNA 번역 기능으로 염기서열 옆에서 바로 상보 서열과 번역 결과를 확인할 수 있으며, 원하는 프레임 또는 6개 프레임 전체를 한 번에 번역할 수 있습니다.

관심 있는 주석이나 선택된 부분만 번역하는 것도 가능합니다. 컨센서스 서열은 다양한 기준에 따라 예측할 수 있으며, 크로마토그램 데이터에서는 품질 기반 컨센서스 기능을 통해 가장 신뢰도 높은 염기를 자동으로 선택합니다.

DNA 서열에 대해서는 염기 일치도, 리드 커버리지, 염기 및 아미노산 빈도, CpG island 등 다양한 통계를 예측할 수 있고, 단백질 서열에 대해서는 분자량, 등전점(pI), 소수성, 막관통 영역, 코일 구조 영역, 아미노산 전하 등도 예측할 수 있습니다.