Extensive Pre-Processing of Sequencing Reads

정확한 분석을 위해 깨끗한 시퀀스 데이터를 준비하세요. Geneious Prime은 전처리 도구를 손쉽게 사용할 수 있도록 제공하여 데이터 품질을 최상으로 유지할 수 있게 합니다.

• 바코드 기반 demultiflexing 및 분할
• 리드 품질 기반 트리밍 및 필터링
• 어댑터 제거
• 페어드 리드 병합
• 중복 제거
• 오류 수정 및 정규화
• 키메라 필터링

Reliable Reference Mapping

Geneious만의 전용 리드 매퍼는 반복적인 정렬 방식으로 구조 변이까지 정확히 정렬해내며, 다른 알고리즘보다 우수한 결과를 제공합니다.

필요에 따라 Bowtie, STAR, BBMap도 선택해 사용할 수 있습니다.

Flexible De Novo Genome Assembly

Geneious Assembler는 시퀀싱 기기 종류나 리드 길이에 관계없이 모든 데이터를 유연하게 처리할 수 있으며, 서로 다른 시퀀싱 플랫폼의 혼합 리드나 페어드 리드도 문제없이 다룹니다. 특히 미생물 유전체 조립에 강하며, 원형 컨티그 생성 기능도 제공합니다.

필요 시 MIRA, SPAdes, Tadpole, Velvet도 손쉽게 실행할 수 있으며, MAUVE를 활용한 유전체 비교 및 마무리 작업도 지원됩니다.