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NGS Visualization and Analysis

주석이 완료된 유전체와 어셈블리의 훌륭한 시각화, 강력한 변이 분석과 RNA-seq 발현 분석

sanger-sequence-analysis

Effortless NGS Visualization and Navigation

클릭 한 번으로 NGS 데이터를 직관적으로 시각화할 수 있습니다. 주석이 포함된 유전체, 원형 유전체, 정렬된 read, contig 등 모든 데이터를 커스터마이징 가능한 시퀀스 뷰어를 통해 확인할 수 있습니다.

원하는 색상, 그래프, 주석 트랙을 선택해 표시하고, 동적인 주석 검색 등 필요한 정보를 빠르게 찾아보세요.

Powerful SNP Variants Analysis

Powerful SNP Variants Analysis

Geneious 알고리즘 또는 FreeBayes를 사용해 SNP와 변이를 손쉽게 탐지할 수 있습니다. 외부에서 제공받은 VCF 파일도 드래그 한 번으로 불러올 수 있으며, 기존 변이와 비교해 새로운 변이를 식별할 수 있습니다.

동적 테이블 뷰에서 필터링과 정렬로 변이를 선별하고, 동기화된 시퀀스 뷰에서 유전체 맥락을 직관적으로 확인하세요.

Simple RNA-Seq Expression Analysis

Simple RNA-Seq Expression Analysis

정렬된 리드를 바탕으로 유전자 발현량을 계산한 뒤, 샘플 간 비교를 통해 차등 발현 유전자를 식별할 수 있습니다. 통계 언어 R에 대한 지식 없이도, 업계 표준인 DESeq2 패키지를 이용해 조건 간(각 조건에 복제 샘플 포함) 발현 차이를 분석할 수 있습니다.

PCA Plot 탭으로 전환해 주성분 분석을 통해 데이터 품질을 확인하고, volcano plot에서는 발현 차이가 큰 유전자를 직관적으로 파악할 수 있습니다. Volcano plot에서 특정 유전자를 선택하면 곧바로 시퀀스 보기로 이동할 수 있으며, 모든 유전자는 발현량 변화에 따라 heatmap 내 여러 색상으로 시각화됩니다.

Amplicon Metagenomics

Amplicon Metagenomics

Geneious Prime에서는 메타유전체 데이터를 조립, 필터링 및 분석할 수 있습니다. Amplicon 데이터는 Sequence Classifier 또는 16S Biodiversity Tool을 통해 분류할 수 있습니다.