Automatic genome annotations

공개 또는 로컬 데이터베이스의 기존 패턴과 주석 정보를 기반으로 새로운 유전체를 자동으로 주석 처리합니다.

과정에서 ORF는 해당 패턴 및 NCBI 검색 결과를 바탕으로 [hypothetical genes]로 자동 지정될 수 있습니다.

Transfer annotations

서열의 유사성을 기반으로 주석을 이관하거나 정렬을 통해 기존 주석을 복사하세요.

Glimmer를 사용하여 유전자를 예측하고, 서열을 복사해 붙여넣는 방식으로 모티프를 검색할 수 있습니다. 또한 Phobos를 이용해 반복 서열(tandem repeats)를 탐지할 수 있습니다.

Real-time sequence prediction

• DNA 번역: 뉴클레오타이드 서열과 함께 번역 및 상보서열을 생성 할 수 있습니다. 원하는 리딩 프레임 또는 전체 6개 프레임에서 번역을 수행하거나, 선택된 영역 또는 주석만 번역할 수 있습니다.
• 컨센서스 서열: 사용자가 선택한 기준에 따라 컨센서스 서열 자동으로 예측. 크로마토그램 데이터에서는 가장 신뢰도 높은 데이터를 자동으로 선택합니다.
• DNA 서열 분석: 염기서열 일치율 · 리드 커버리지(coverage) · 염기 빈도 · CpG island 등 다양한 통계 예측을 수행할 수 있습니다.
• 단백질 서열 분석: 분자량 · 등전점 · 소수성 · 막관통 영역 · 코일 구조 · 전하 등 다양한 특성을 예측할 수 있습니다.