Oxford nanopore technologies 시퀀서를 이용해 도출한 fastq 파일로부터 target에 대한 consensus sequence를 얻으려고 합니다.
Trim-map to reference-extract consensus 순으로 진행했는데, ONT사에서 제공하는 workflow로 도출한 consensus sequence와 서로 다른 결과를 얻게 되었습니다.
제가 설정한 파라미터가 geneious prime에서 권장하는 파라미터와 동일한지 알고싶은데, 혹시 관련 지원이 가능할까요?
제가 설정했던 파라미터를 첨부드립니다.
유선 혹은 이메일로답변 부탁드립니다.
감사합니다.